Đánh giá các phương pháp, quy trình nhận dạng chuỗi plasmid hiện nay và áp dụng trên dữ liệu mô phỏng

Abstract

Việc hiểu biết về di truyền của vi khuẩn và các cơ chế đằng sau khả năng kháng kháng sinh phụ thuộc quan trọng vào việc phát hiện plasmid. Trong bài viết này, chúng tôi cung cấp một phân tích toàn diện về các công cụ nhận diện plasmid khác nhau, bao gồm các phương pháp dựa trên căn chỉnh, dựa trên học máy, và phương pháp lai. Các nhà nghiên cứu và chuyên gia có thể thu được nhiều thông tin hữu ích từ việc xem xét ưu và nhược điểm của từng phương pháp. Chúng tôi cũng làm rõ các quy trình làm việc được sử dụng để chuẩn bị dữ liệu và đánh giá các công cụ này bằng cách sử dụng cả dữ liệu tổng hợp từ NCBI. Qua nghiên cứu kỹ lưỡng, chúng tôi chứng minh rằng các quy trình đề xuất có hiệu quả và độ tin cậy cao trong việc nhận diện chính xác plasmid trong cả môi trường mô phỏng và thực tế. Những phát hiện này góp phần vào khoa học nhận diện plasmid và mở ra hướng nghiên cứu tiếp theo về kháng kháng sinh và di truyền vi sinh vật.